Stonek (cauloma) je nadzemní částí rostliny, který nese listy a společně se někdy označují jako prýt. Na vzrostném vrcholu prýtu vznikají listy v pravidelném postavení, organizace vzrostného vrcholu je u prýtu komplikovanější než u kořene, neboť apikální meristém prýtu určuje nejen vznik stonku, ale také listů a pupenů v jejich úžlabí.
Svazky cévní ve stoncích vedou vodu a živiny z kořenů do listů a obráceně asimiláty z listů do kořenů (případně do místa spotřeby nebo uložení). Kromě toho zastávají stonky i funkci asimilační a transpirační, a pokud tloustnou, plní i funkci zásobní.
Podobně jako u kořene bude věnována pozornost především anatomické stavbě různých typů stonků na jejich příčných řezech.