Vzrostný vrchol (apex) kořene je chráněn kořenovou čepičkou (kalyptrou) před poškozením při pronikání půdou. Vnější buňky kalyptry slizovatí a usnadňují tím pronikání kořene půdou. Ve střední části čepičky - ve sloupku - se nachází přesýpavý škrob, který slouží percepci zemské tíže.
V určité vzdálenosti od apikálního meristému hlavního kořene vznikají postranní kořeny. Apex kořene má zřetelný inhibiční vliv na růst postranních kořenů, což souvisí s tvorbou fytohormonů (cytokininů a kyseliny abscisové) v kořenové špičce. Postranní kořeny se zakládají většinou v kořenovém pericyklu (perikambiu) hlavního kořene a prorůstají jeho primární kůrou.
Obrázek: Vznik postranních kořenů
Růst postranních kořenů prvního řádu je víceméně kolmý na působení zemské tíže, postranní kořeny dalších řádů jsou na gravitaci necitlivé.
Obrázek: Morfologie klíční rostlinky hrachu setého (Pisum sativum)Na kterékoliv části rostlin (nejčastěji na stoncích a listech) se mohou endogenně vytvářet adventivní kořeny. Toho se velmi dloho využívá při vegetativním množení rostlin listovými nebo stonkovými řízky. Tvorba adventivních kořenů na intaktních rostlinách je podněcována regulačními látkami auxinové povahy.